Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg16l1Q8C0J2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg16l1Q8C0J2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg16l1Q8C0J2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg16l1Q8C0J2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg16l1Q8C0J2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg16l1Q8C0J2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg16l1Q8C0J2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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