Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY35

Fgd2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd2Q8BY35 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms