Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Catsper4Q8BVN3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms