Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms