Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubr7Q8BU04 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms