Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BP99 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BP99 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BP99 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms