Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms