Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem260Q8BMD6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem260Q8BMD6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms