Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms