Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc4Q8BKW4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms