Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc2Q8BKV1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms