Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atl1Q8BH66 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms