Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a9Q8BGD6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a9Q8BGD6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms