Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pknox2Q8BG99 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms