Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdspl2Q8BG15 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms