Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms