Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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ChfrQ810L3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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ChfrQ810L3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ChfrQ810L3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ChfrQ810L3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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ChfrQ810L3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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ChfrQ810L3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChfrQ810L3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ChfrQ810L3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms