Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Zbed4Q80WQ9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms