Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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