Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc2Q80W04 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms