Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms