Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Lrrc1Q80VQ1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Lrrc1Q80VQ1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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