Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rpp38Q80UU2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rpp38Q80UU2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rpp38Q80UU2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rpp38Q80UU2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpp38Q80UU2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rpp38Q80UU2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rpp38Q80UU2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rpp38Q80UU2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rpp38Q80UU2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms