Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NischQ80TM9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
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