Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Clec4b1Q7TS58 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4b1Q7TS58 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec4b1Q7TS58 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec4b1Q7TS58 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec4b1Q7TS58 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec4b1Q7TS58 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4b1Q7TS58 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4b1Q7TS58 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4b1Q7TS58 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4b1Q7TS58 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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