Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms