Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actn1Q7TPR4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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