Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ShprhQ7TPQ3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ShprhQ7TPQ3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms