Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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