Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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