Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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