Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snd1Q78PY7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms