Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms