Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms