Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf3Q6ZQA6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms