Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80Q6ZPV2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80Q6ZPV2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms