Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx9Q6XAS3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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