Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Timd4Q6U7R4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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