Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GcsamQ6RFH4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms