Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms