Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tmeff1Q6PFE7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tmeff1Q6PFE7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tmeff1Q6PFE7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tmeff1Q6PFE7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tmeff1Q6PFE7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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