Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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