Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6PD19 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6PD19 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6PD19 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6PD19 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms