Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RgmaQ6PCX7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RgmaQ6PCX7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms