Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms