Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp49Q6P9L4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms