Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg2aQ6P4T0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms