Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms