Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms