Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ltv1Q6NSQ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ltv1Q6NSQ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ltv1Q6NSQ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ltv1Q6NSQ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ltv1Q6NSQ7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ltv1Q6NSQ7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms